يعود أصل دير كوسا إلى دير القديس أندرو في إيكسالادا، الواقع أعلى في وادي التيت، والذي تأسس حوالي عام 840.

• منظر لدير القديس ميخائيل في كوسا

في خريف عام 878، جرف فيضان مفاجئ في وادي التيت، ناجم عن أمطار غزيرة، دير القديس أندرو (الذي كان يقع بالقرب من مجرى النهر، في موقع ينبع منه ينابيع حارة معروفة منذ العصور القديمة). لجأ الرهبان الباقون على قيد الحياة، وعددهم 35 راهباً، إلى كوسا، حيث كانت هناك كنيسة مخصصة للقديس جيرمان، ملكية الكاهن بروتاس (بروتياسيوس) الذي انضم، مع بعض رفاقه، إلى جماعة القديس أندرو في عام 854. وثيقة مؤرخة في 3 يوليو 879 حددت الوضع القانوني لرهبان القديس جيرمان: شكلوا جماعة رهبانية وأصبح بروتاس أول رئيس لهم.

استمر الدير الجديد في الاستفادة من حماية وسخاء كونتات سردانية-كونفلت، الذين ينحدرون من غيفر الأول الصلب (ويفريدوس)، كونت برشلونة في عام 870، الذين وسعوا ممتلكاتهم العقارية بشكل كبير. حصل الدير على امتيازات من البابوية والملك المتكررة من الحصانة، مما جعله يخضع فقط لسلطة البابا أو الملك. سونهريد الثاني من سردانية، أوكل دير كوسا قبل عام 965 إلى رئيس الدير غارين (وارينوس)؛ الذي أدخل إصلاحات على غرار دير كلوني، وقطع آخر صلاته مع النظام الملكي الكارولنجي. كان غارين بالفعل يقود خمسة أديرة في جنوب فرنسا، وكان له علاقات واسعة مع الخارج.